Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BBS2Q9BXC9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms