Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
THUMPD2Q9BTF0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms