Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C2orf88Q9BSF0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms