Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HINFPQ9BQA5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms