Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYD88Q99836 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms