Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms