Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms