Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPNS2Q96L46 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms