Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms