Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms