Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMTQ93088 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms