Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms