Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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COPS9Q8WXC6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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COPS9Q8WXC6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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