Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms