Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms