Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms