Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms