Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms