Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms