Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms