Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPTE2Q6XPS3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms