Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC174Q6PII3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC174Q6PII3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms