Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms