Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDE2Q6IQ49 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms