Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms