Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms