Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms