Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms