Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms