Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms