Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHKAPQ2M3C7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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