Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms