Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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