Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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