Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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