Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms