Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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