Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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