Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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