Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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ZFHX3Q15911 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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ZFHX3Q15911 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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