Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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