Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms