Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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