Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHBQ15464 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHBQ15464 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHBQ15464 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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