Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms