Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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RAB39AQ14964 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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