Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms