Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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