Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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