Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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